一、综合科：位于宝琛图书馆5楼南侧，主要负责行政管理和业务协调工作。

二、资源建设部：位于宝琛图书馆1楼，主要负责文献资源的采访、分类、编目、典藏。

三、数字化与技术服务部，位于宝琛图书馆1楼，主要负责图书馆系统维护、网络、微媒体服务等现代技术应用与管理以及电子阅览室维护等工作。

四、读者服务部：位于宝琛图书馆1楼，主要负责信息咨询、阅读推广以及文献资源的流通、阅览、空间管理和部门的日常管理，并协助做好学科服务等工作；读者服务部下设：

1、社会科学书库（一）（F-K类），位于宝琛图书馆3楼。

2、信息共享空间，位于图书馆3、4楼。

3、社会科学书库（N-Z类），位于宝琛图书馆4楼。

4、社会科学书库（二）（A-E类）、特藏书库及报刊阅览室，位于宝琛图书馆5楼。

5、密集书库（一、二），位于宝琛图书馆1楼。